Pedoman Pelaksanaan UKS di Sekolah/Madrasah yang disusun oleh Direktorat Jenderal Pendidikan Dasar ini, bertujuan agar para Kepala Sekolah/Madrasah dan guru sebagai Tim Pelaksana UKS dapat lebih mengimplementasikan program UKS dengan baik, sehingga sangat membantu pencapaian tujuan akhir dari program ini yaitu meningkatkan prestasi belajar peserta didik melalui peningkatan derajat kesehatan. Dalam pedoman ini berisi bagaimana melaksanakan UKS secara benar yang meliputi bagaimana pembentukan Tim Pelaksana UKS, penyusunan rencana/program UKS bagi Tim Pelaksana UKS, dan cara melaksanakan program UKS serta bagaimana cara melaksanakan monitoring, evaluasi, dan pelaporannya.